Le port de Ciboure est un port de pêche qui abrite une flotille de bateaux pour une pêche artisanale. A la grande époque du port, la pêche du thon et de la sardine battait son plein, de nombreuses conserveries vivaient alors de cette pêche. Les conserveries ont disparu, seule une pêche artisanale mais de qualité subsiste dans le port. Le port reste cependant un point important de ventes, la criée du port prenant la pêche de bateaux venus d'autres régions. Une vente directe du poisson (du bateau au consommateur) s'effectue dans un local du port. Ciboure abrite également un port de plaisance à Ciboure et un port de plaisance à Socoa. Vous pourrez également voir et visiter un bateau de pêche traditionnelle représentant de la pêche basque, le Patchiku. Ce bateau a été restauré à l'identique dans le chantier naval Marin à Ciboure. Il est classé monument historique. L'association Patchiku vous propose de le visiter ou de naviguer à son bord. Accès vers la mer, Ciboure a un Lycée Maritime qui enseigne les différentes formations des métiers de la mer.
